Biologisen mikroskoopin suurennus on tyypillisesti pieni, vaihdellen 40x - 1000x. Tämä johtuu siitä, että biologiset näytteet ovat yleensä läpinäkyviä ja vaativat kohtalaisen suurennuksen solujen ja kudosten rakenteiden tarkkailemiseksi.
Biologisessa mikroskoopissa suurennus määräytyy objektiivin ja okulaarin yhdistelmällä. Yleisiä objektiivilinssien suurennoksia ovat 4x, 10x, 40x ja 100x, kun taas okulaarin suurennus on tyypillisesti 10x. Siksi tyypillisen biologisen mikroskoopin suurin suurennus on 100x objektiivi kerrottuna 10x okulaarilla, mikä vastaa 1000x.
On tärkeää huomata, että biologisen mikroskoopin suurennus ei ole yhtä suuri kuin elektronimikroskoopin, koska biologiset näytteet ovat usein rakenteeltaan monimutkaisia ja havainnointiprosessi edellyttää näytteiden elinkelpoisuuden ja eheyden säilyttämistä. Lisäksi biologisen mikroskoopin resoluutio on myös ratkaiseva, koska biologiset rakenteet ovat usein hyvin pieniä ja vaativat korkeaa resoluutiota hienojen yksityiskohtien havaitsemiseksi.
Tietyissä erikoissovelluksissa, jotka vaativat suurempaa suurennusta, kuten patologinen tutkimus tai mikrokirurgia, suuremman suurennoksen okulaaria (esim. 16x tai enemmän) voidaan käyttää yhdessä sopivien okulaarien kanssa suuremman suurennuksen saavuttamiseksi. Nämä suurennoshavainnot vaativat kuitenkin yleensä monimutkaisempia näytteenvalmistus- ja mikroskopiatekniikoita ja vaativat käyttäjältä suurempaa taitoa.